A partir de 2003, cuando varios países de Asia sudoriental notificaron casi en forma simultánea la presencia de brotes de Influenza Aviar Altamente Patógena (IAAP) H5N1, la FAO se encuentra trabajando con estos países afectados y los que se encuentran en riesgo de ser infectados en Asia, áfrica, Europa oriental, el Cáucaso, el Medio Oriente, América Latina y el Caribe, con la finalidad de apoyar la creación de capacidad de sus servicios veterinarios, difusión de información y formación de redes de comunicación, utilizando para ello sus propios fondos y contribuciones extrapresupuestarias de donantes multilaterales y bilaterales.

El principal objetivo de estas operaciones era, es y seguirá siendo, fortalecer la vigilancia de la enfermedad, prevención y respuesta rápida en situaciones de emergencia, el estudio de la función de las aves migratorias en la propagación de la enfermedad, apoyar la generación de una comunicación de riesgos responsable, analizar las consecuencias sociales y económicas de la enfermedad y las medidas para combatirla, fortaleciendo la supervisión sobre el terreno, la capacidad de los laboratorios de diagnóstico y reforzar la vigilancia de la enfermedad y la alerta temprana.

La FAO. Entre el 2004 y 2005, desplegó 272 misiones de apoyo a los países donde hubo brotes de influenza aviar (H5N1) y a los que estaban en peligro de sufrirlos, a menudo en colaboración con la Organización Mundial de Sanidad Animal (OIE), la Organización Mundial de la Salud (OMS), el Banco Mundial (BM) y la Comunidad Europea (CE).

Hasta ahora, la FAO ha dado apoyo para combatir y prevenir la influenza aviar a través de servicios y suministros a 95 países.

En 2004 la FAO estableció el Centro de Emergencia para la Lucha contra las Enfermedades Transfronterizas de los Animales (ECTAD), una plataforma conjunta para la ejecución del programa de sanidad animal de la FAO relacionado con las crisis como la influenza aviar y la fiebre aftosa. Este mecanismo combina las responsabilidades técnicas de la formulación del programa por parte del Servicio de Sanidad Animal de la FAO (AGAH), bajo la dirección del jefe del servicio veterinario de la FAO, con la capacidad de ejecución de programas del Servicio de Operaciones de Emergencia de la FAO (TCEO), con su amplia experiencia y especialización operativa.

La FAO ha ayudado a los países en la elaboración y ejecución de estrategias nacionales y regionales de emergencia y lucha de mediano y largo plazo, mediante la evaluación de la capacidad humana, infraestructura y políticas para la vigilancia, detección y lucha contra la influenza aviar, observando las consecuencias socioeconómicas de las crisis, así como los costos y las consecuencias de las medidas de control y del restablecimiento y reestructuración del sector avícola.

La FAO y la OIE elaboraron un plan mundial de lucha gradual contra la influenza aviar, y crearon una Red Mundial sobre la Influenza Aviar (OFFLU), con el fin de coordinar las investigaciones, proporcionar diagnósticos confirmativos, dar apoyo a los países mediante el suministro de expertos y mantener un enlace con la OMS en el análisis de las cepas del virus.

La FAO, en colaboración con la OIE y la OMS, se ocupa de las actividades mundiales de alerta rápida sobre la influenza aviar, a través del Sistema mundial de información y alerta (SMIA), situado en la sede de la FAO, Roma, para las enfermedades transfronterizas de los animales y las zoonosis.

La FAO dirige el Sistema de las Naciones Unidas de Coordinación para la Influenza Aviar (UNSIC), creado por el Secretario General de la ONU, Kofi Annan, en septiembre de 2005 como organización especializada, con participación de todos los organismos pertinentes, encargada de ayudar a los países miembros a combatir la enfermedad en su origen en los animales.

El Continente Americano actualmente se encuentra libre de la Influenza Aviar Altamente Patógena (IAAP) – H5N1 asiático, por lo que la FAO a través de su Oficina Regional para América Latina y el Caribe, en seguimiento a los principios de EMPRES esta enfocada a realizar las actividades de prevención y detección temprana de la enfermedad, para disminuir las posibilidades de que ocurra un brote de IAAP y en caso de que se presente, pueda ser controlado a la brevedad posible permitiendo que la provincia o país donde ocurra este en condiciones de recuperar en el menor tiempo su condición internacional de libre de la IAAP.

Para prevenir un brote de gripe aviar en América Latina, la FAO está coordinando labores de prevención y detección mediante la implementación de cuatro proyectos regionales de asistencia técnica que cubren un total de 33 países en las sub-regiones de el Caribe (TCP/RLA/3103), América Central (TCP/RLA/3104), Región Andina (TCP/RLA/3105) y Cono Sur (TCP/RLA/3106), incluyendo operaciones de coordinación con Canadá y los Estados Unidos de Norte América. Sus actividades incluyen la creación de un sistema de información georeferenciada para aves de corral y aves silvestres, capacitaciones en diagnóstico de laboratorio, vigilancia epidemiológica, la actualización de los planes de contingencia nacionales, ejercicios de simulacro frente a la aparición de la enfermedad y la preparación de materiales de comunicación y educación, entre otras.