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El Codex Alimentarius es un conjunto de normas alimentarias internacionales adoptadas o aprobadas por la Comisión del Codex. En tal sentido se denomina Codex tanto a las normas como al órgano ejecutivo que es la Comisión.

El Codex se crea en el año 1962 cuando la FAO y la OMS se reúnen para poner en marcha el Programa Conjunto FAO/OMS sobre Normas Alimentarias. Se crea para responder al creciente interés de los países miembros para que se adopten medidas para proteger la salud de los consumidores y asegurar las prácticas equitativas en el comercio de alimentos.

El Codex tiene o emite normas para todos los alimentos principales, ya sean elaborados, semielaborados o crudos. Comprende, además, todas las materias primas que se utilizan para la elaboración de alimentos. Además de las normas para productos, el Codex redacta también Códigos de Práctica y Directrices, que son disposiciones de carácter recomendatorio.

El Codex ha tomado gran relevancia desde la formación de los Acuerdos de Medidas Sanitarias y Fitosanitarias (MSF) y Obstáculos Técnicos al Comercio (OTC) de la Organización Mundial de Comercio (OMC) que lo han reconocido como el órgano internacional de armonización para el establecimiento de normas sobre inocuidad de los alimentos, siempre destinadas a cumplir con los objetivos del Codex: Proteger la salud del consumidor y Asegurar Prácticas Leales en el Comercio de Alimentos.

El Acuerdo sobre MSF estipula que las normas sobre inocuidad de los alimentos son las que se refieren a los aditivos alimentarios, residuos de plaguicidas y medicamentos veterinarios, contaminantes, métodos de análisis y de muestreo, códigos y directrices de prácticas de higiene.

El Codex proporciona una orientación de referencia a los Estados Miembros para que adopten o armonicen su legislación en base a sus normas, códigos de prácticas y directrices que dicta la comisión. Asimismo sus normas sirven como punto de referencia para la acción de la OMC.

Está estructurado en Comités, que pueden ser generales (horizontales) o por productos (verticales)

Hay más de 300 normas, directrices y otras recomendaciones del Codex relativas a la calidad e inocuidad de los alimentos. Como resultado de la labor realizada, se ha evaluado la inocuidad de más de 760 aditivos y contaminantes alimentarios, y se han definido más de 2.500 límites máximos para residuos de plaguicidas y más de 150 para medicamentos veterinarios. Además el Codex ha establecido niveles de referencia para una serie de contaminantes industriales y ambientales (incluidos los radionucleidos) de los alimentos.

La higiene de los alimentos ha sido uno de los campos donde la Comisión del Codex Alimentarius ha desarrollado más actividades desde su creación. El Comité del Codex sobre Higiene de los Alimentos, que cuenta con el auspicio del Gobierno de los Estados Unidos como país anfitrión, fue fundado en 1963. En vista que la higiene de los alimentos se regula mejor en la etapa de producción y elaboración en el país exportador, el Comité ha centrado su labor en la preparación de códigos de prácticas de higiene, en lugar de normas microbiológicas aplicables al producto final.

Es por ello que la Comisión del Codex adoptó el Sistema de Análisis de Peligros y de Puntos Críticos de Control (APPCC) (siglas en inglés HACCP), que fueron elaboradas por el Comité sobre Higiene de los Alimentos. Al hacerlo, reconoció que el APPC era un instrumento para evaluar los peligros y establecer sistemas de control centrados en medidas preventivas, en vez de depender de los análisis del producto final.